种子植物引物通用性分析研究＊

• 作者: 刘金欣 姚辉 宋经元 徐晓兰 石林春 谢彩香 辛天怡
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 学科: 医学
• 关键词: DNA条形码 种子植物 matK 引物通用性
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 页码范围: 381-386
• 页数: 6页
• 分类号: R282.5
• 字数: 2719字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.2013.03.008

摘要

matK 是植物DNA条形码鉴定的核心序列之一，其引物通用性一直存在争议。然而，matK不同引物通用性的差异及其在不同植物类群中通用性的差异尚缺乏系统研究。本研究收集种子植物36个目，239个科，3292个属11429个种的14563条全长matK 序列。利用生物信息学方法，分析13对 matK 引物及其78种两两引物组合的通用性。结果表明引物 xf/5r、1F/8R、390F/1326R 和3F_KIM/1R_KIM 是通用性最高的4对引物，在所有种子植物中分别为91.18%、84.65%、79.81%和80.94%；不同种子植物类群（目），通用性最高的引物存在差异；xf/5r是引物组合的基础序列，1F/8R、1F/1R、M3/M4和3F_KIM/1R_KIM可作为引物组合的补充引物。本研究为种子植物不同类群（目）DNA条形码鉴定matK序列引物的选择提供有价值的参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	辛天怡	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	14	200	8.0	14.0
2	姚辉	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	42	752	18.0	26.0
3	谢彩香	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	54	621	14.0	20.0
4	宋经元		65	1414	26.0	34.0
5	石林春	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	19	279	11.0	16.0
6	刘金欣	北京师范大学资源学院资源生态与中药资源研究所	6	64	4.0	6.0
7	徐晓兰	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	1	3	1.0	1.0