新开发的禾本科通用性分子标记的检测与评估

• 作者: 李兵娟 肖国辉 许在恩 郭小勤
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 植物学 竹类植物 通用性分子标记 单拷贝同源基因(COSⅡ) 单核苷酸多态(SNP) PCR-RFLP
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 508-514
• 页数: 7页
• 分类号: S718.46
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.04.003

摘要

为开发更多的适用于禾本科Poaceae植物通用性分子标记,丰富竹类植物的遗传信息,依据禾本科单拷贝同源基因(COSⅡ)已知序列的保守区域设计了14对引物,以此引物对刚竹属Phyllos tachys植物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,并对部分扩增产物进行测序.结果所有引物可以在至少1个材料中得到特异性扩增,其中7对引物在5个供试材料中均能扩增到产物,13对引物在5个样本中表现出多态性,占引物总数的92.9％.对部分扩增产物进行测序,所测序列均为特异性扩增序列.同一引物在不同样本中的扩增片段间存在单核苷酸多态性(SNP)位点,部分SNP位点会导致氨基酸序列提前终止或酶切位点变化.对有合适内切酶存在的变异位点进行PCR-RFLP验证,验证结果与测序结果一致.利用NTsys 2.10e软件,对5个供试竹种材料进行了亲缘关系分析,毛竹Phyllostachysedulis与绿粉竹Phyllostachys virdiglaucescens亲缘关系最近,紫竹Phyllostachys nigra与其他4个竹种亲缘关系最远.所开发的14个COSⅡ引物在刚竹属植物中具一定通用性,同时挖掘出更多竹类植物中的遗传信息.