花椒cpSSR标记开发及在种间、种内的通用性分析

• 作者: 刘洪妤 刘玉林 张志东 张野 李思巧 王丽华 韦伊
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 植物学 花椒 叶绿体基因组 简单序列重复(SSR) 多态性分析
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1241-1246
• 页数: 6页
• 分类号: S565.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2019.06.023

摘要

叶绿体基因组为母系遗传,保守性高,因此叶绿体基因组中的简单序列重复(SSR)标记可在更高分类水平上进行种质资源鉴定和群体遗传结构分析.利用TRF软件和SSR Hunter软件相结合对花椒Zanthoxylum bungeanum叶绿体基因组中的SSR位点进行筛选.结果显示:花椒叶绿体基因组中共有144个SSR位点,位点间的平均分布距离为1100.00 bp.基于检测软件设置参数,SSR重复类型主要集中在一、 三核苷酸重复,二者占SSR位点总数的91.67％.此外,随机设计合成30对SSR引物对10份花椒种质、5份竹叶花椒Zanthoxylum armatum种质和1份日本花椒Zanthoxylum piperitum种质进行PCR扩增检测,共筛选出10对多态性引物,其中单核苷酸重复位点的多态性高于多核苷酸重复位点.本研究开发的叶绿体SSR标记可有效区分花椒、 竹叶花椒和日本花椒,但在花椒种内并未检测出多态性.表明花椒叶绿体基因组的SSR标记可用于花椒属Zanthoxylum不同种间的遗传多样性分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘玉林	西北农林科技大学林学院	12	35	3.0	5.0
2	王丽华	四川省林业科学研究院生物技术与良种研究所	7	32	3.0	5.0
3	李思巧	西北农林科技大学林学院	1	0	0.0	0.0
4	韦伊	西北农林科技大学林学院	1	0	0.0	0.0
5	刘洪妤	西北农林科技大学林学院	1	0	0.0	0.0
6	张志东	西北农林科技大学林学院	1	0	0.0	0.0
7	张野	西北农林科技大学林学院	1	0	0.0	0.0