中国大麦地方品种的遗传多样性及α-淀粉酶活性的全基因组关联分析

• 作者: 姜晓东 张京 郭刚刚
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 中国大麦 遗传多样性 等位变异效应 α-淀粉酶活性 关联分析
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 668-677
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.04.002

摘要

[目的]了解中国大麦地方品种的遗传多样性,为大麦α-淀粉酶活性基因寻找有效的分子标记.[方法]利用覆盖全基因组的41对简单重复序列(SSR)标记引物,对257份中国大麦地方品种进行PCR扩增；采用Nei's遗传距离和邻接(neighbour-joining)法进行聚类分析；在对群体结构和连锁不平衡分析的基础上,进行基于全基因组的表型与基因型的关联分析.[结果]共鉴定出709个等位变异,平均每个位点的等位变异数为17个.41个SSR标记位点的多态性信息指数(PI)变化范围为0.23(Bmag 0385)-0.94(Bmac0032),平均为0.6385.257个中国大麦地方品种聚合成9个不同的结构类群,发现5个与大麦α-淀粉酶活性显著关联的标记位点.[结论]中国大麦地方品种中蕴藏着丰富的遗传等位变异；各类群的特性和品种来源符合“遗传关系密切、表型特征特性相同、地理生态相近”的同类群聚集规律.在5个关联位点中,位于7H染色体上的Bmag0385位点,其等位变异A215的酶活增强效应最大；此外,7H上Bmac0273的等位变异A141的增效作用较大,可用于啤酒大麦育种的分子标记辅助选择.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张京	中国农业科学院作物科学研究所	41	691	17.0	25.0
2	姜晓东	山西农业大学农学院	9	34	4.0	5.0
3	郭刚刚	中国农业科学院作物科学研究所	7	31	4.0	5.0