沈抚灌区广宿主石油烃代谢质粒的分离及鉴定

• 作者: 李小彬 李慧 王亚菲
• 来源期刊: 应用生态学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水平基因转移 三亲配对外源质粒分离 广宿主质粒 石油烃降解 生物修复
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 页码范围: 3289-3299
• 分类号: Q938.1
• 语种: 中文

摘要

本研究采用“三亲配对外源分离法”,从沈抚灌区土壤、底泥和水样中共计分离得到8个广宿主(BHR)石油烃代谢质粒,并通过对其进行抗生素抗性检测和抗性遗传标记,将其转移至大肠杆菌(Escherichia coli)EC100宿主中进行操作.不相容性群分析结果表明:pS3-2C、pS4-6G为Inc P质粒;pS3-2G、pW22-3G、pA15-7G为Inc N质粒;pS7-2G为Inc W质粒;pA23-1G和pA10-1C为Inc Q质粒.采用PCR扩增已报道的石油烃污染物降解基因的方法初步分析其石油烃代谢功能,质粒pS3-2G、pS7-2G、pA23-1G、pW22-3G和pA10-1C上含有编码芳香环羟化双加氧酶基因(phdA)和甲苯单加氧酶基因(touA)的片段;pA15-7G含有编码甲苯双加氧酶和甲苯单加氧酶基因片段;pS3-2C含有编码芳香环羟化双加氧酶、苯双加氧酶和甲苯双加氧酶基因片段;pS4-6G仅含有编码芳香环羟化双加氧酶基因片段.通过宿主范围检测,除质粒pS3-2C外,其余7个质粒均可在变形菌纲(Proteobacteria)α-、β-、γ-亚纲的代表性菌株根瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)C58、钩虫贪铜菌(Cupriavidus necator)JMP228、大肠杆菌EC100间进行转移并稳定传代.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李慧	中国科学院沈阳应用生态研究所森林与土壤生态国家重点实验室	120	1144	19.0	29.0
2	王亚菲	中国科学院沈阳应用生态研究所森林与土壤生态国家重点实验室	4	26	2.0	4.0
6	李小彬	中国科学院沈阳应用生态研究所森林与土壤生态国家重点实验室	1	2	1.0	1.0