5种microRNA检索引擎的应用和比较

• 作者: 刘辰庚 王培昌
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 关键词: 生物信息学 检索 微RNAs
• 年，卷（期）: 2013,（13）
• 所属期刊栏目: 检验技术与方法
• 页码范围: 1725-1727
• 页数: 3页
• 字数: 2520字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2013.13.042

摘要

目的 对miRBase等5种microRNA(miRNA)检索引擎的功能、特点等作一比较分析.方法 使用人、小鼠和大鼠3个种属及hsa-miR-92b等5种miRNA对miRBase等5种数据库的容量、检索功能特点、预测准确性等方面进行检索分析.结果 miRBase的种属收录量、单一种属中miRNA的收录量都是最多的.针对5种人源miRNA的靶基因检索,RNA22和TargetScan的数据返回量显著小于miRBase(P＜0.05),miRGen Targets的数据返回量显著多于miRBase(P＜0.05),其中miRGenTarget和miRBase对APP检索结果的重合率最高.结论 miRNAbase的综合检索能力和功能设置最为全面,对不同搜索引擎的功能和检索结果进行综合分析及合理利用将有助于研究效率的提高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王培昌	首都医科大学宣武医院检验科	161	782	15.0	19.0
2	刘辰庚	首都医科大学宣武医院检验科	42	117	6.0	7.0