基于宏基因组数据的微生物群落比较方法

• 作者: 常秦 黎珊
• 来源期刊: 科学技术与工程
• 学科: 生物学
• 关键词: 宏基因组 16S rRNA 全基因组测序 群落比较 系统发生树
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 2457-2464
• 页数: 8页
• 分类号: Q93-31
• 字数: 6648字
• 语种: 中文

摘要

宏基因组学是一门研究直接来自环境的基因材料的新兴学科.传统的微生物学研究,依赖于实验室培养,而宏基因组学,使得对这些未被培养或不可培养的微生物的研究成为可能,也为同一环境中微生物之间相互作用的研究,以及微生物群落的整体研究,指明了新的方向.随着测序技术的迅速发展,大量宏基因组测序数据不断产生,对新的统计分析方法提出了更高的要求.简要介绍了宏基因组学以及其中的几个重要问题,主要针对其中基于测序数据的群落比较问题进行论述,介绍了多种现今常用的统计计算方法,并分析了它们的适用情况.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常秦	山东大学数学学院	1	7	1.0	1.0
2	黎珊	山东大学数学学院	1	7	1.0	1.0