蓝藻非编码RNA Yfr7的生物学特征分析

• 作者: 张莹 李益 杨峰 杨阳 饶妮妮
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蓝藻 Yfr7 调控 分子功能 进化
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 24-34
• 页数: 11页
• 分类号: Q74
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2014.30163

摘要

Yfr家族是广泛存在于蓝藻基因组中的一类非编码RNA,在细胞代谢和环境适应方面发挥重要作用.文中选取Yfr7作为研究对象,首先根据序列特征确定Yfr7的二级结构,然后结合动态规划和自由能的计算方法预测Yfi7的调控基因,从细胞定位、分子功能和调控路径三方面对这些基因进行分析,以快速发现Yfr7的功能,最后通过构建进化树来揭示Yfr7的遗传特征.结果表明:Yfr7拥有独立的启动子区和操纵子,通过保守片段5'-GTGCTCTGATCTGACT-3'与目标mRNA序列互补来调控特定基因的表达;目标基因包括看家基因和酶基因,这些目标基因的功能说明Yfr7广泛参与细胞的次级代谢;进化树聚类表明Yfr7与菌株光照类型有关,参与蓝藻最重要的光合反应;Yfr7与6S RNA在序列、结构和遗传距离上都高度一致,推测可能来自同一个祖先.这些研究结果可为进一步开展相关实验研究提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨峰		74	423	13.0	16.0
2	饶妮妮		54	440	12.0	18.0
3	杨阳		14	11	2.0	3.0
4	李益		4	5	1.0	2.0
5	张莹		2	3	1.0	1.0