分子动力学和丙氨酸变异研究MDM2与抑制剂P4的结合模式

• 作者: 张少龙 张庆刚 时术华 梁志强 段莉莉 王伟 陈建中
• 来源期刊: 原子与分子物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 分子动力学 丙氨酸变异 MM-PBSA p53-MDM2相互作用
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 原子分子物理交叉学科
• 页码范围: 311-316
• 页数: 6页
• 分类号: Q641.12
• 字数: 3488字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0364.2014.02.023

摘要

抑制p53-MDM2相互作用已经成为癌症治疗的新途径.采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Possion-Bohzmann surface area)方法研究了肽类抑制剂P4与MDM2的结合模式.研究表明P4与MDMD2疏水性裂缝的范德华作用是抑制剂结合的主导力量.采用丙氨酸变异计算研究了P4与MDM2的作用热区.结果表明残基Lys51,Leu54,Leu57,Ile61,Met62,Tyr67,Gln72,His73,Val93,His96和Ile99的丙氨酸变异导致了范德华作用的降低,而对极性相互作用几乎没有产生影响,同时也证明这些残基处于P4与MDM2作用表面的热区,对抑制剂的结合有重要贡献,这能为抗癌药物的设计提供理论上的指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	时术华	山东建筑大学理学院	15	22	2.0	3.0
2	王伟	山东交通学院理学院	16	59	3.0	7.0
3	段莉莉	山东师范大学物理与电子科学学院	10	10	2.0	2.0
4	张庆刚	山东师范大学物理与电子科学学院	71	240	8.0	11.0
5	梁志强	山东交通学院理学院	20	50	3.0	5.0
6	张少龙	山东师范大学物理与电子科学学院	29	118	6.0	9.0
7	陈建中	山东交通学院理学院	9	18	3.0	4.0