高通量技术解析锡林河底泥反硝化菌群组成及丰度

• 作者: 于景丽 史昊先 范雅慧 赵吉 高晓霞
• 来源期刊: 微生物前沿
• 学科: 地球科学
• 关键词: 焦磷酸测序 反硝化细菌 群落组成 丰度 锡林河底泥
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 页码范围: 70-78
• 页数: 9页
• 分类号: X1

摘要

反硝化菌驱动的脱氮作用是全球氮循环的重要环节,其群落组成及丰度对气态氮产生的类型和排放量有调控作用。本文结合文献报道的反硝化细菌属,基于16S rRNA基因454焦磷酸测序检测了锡林河底泥中反硝化细菌群落结构组成和丰度。结果发现:5744条优化序列在“属”水平上聚类成2263个OTUs,与GenBank中已知序列比对后获得未分类的细菌属占57.49%。已分类的204个细菌属中20个为反硝化细菌属,包括Flavobacterium 1.40%,Hydrogenophaga 1.23%,Bacillus和Thauera 0.19%,Thiobacillus 0.17%,Hyphomicrobium 0.15%等。其中,黄杆菌属Flavobacterium和噬氢菌属Hydrogenophaga是锡林河底泥中最丰富的反硝化细菌,共占反硝化菌群总组成的69.03%。相关性分析表明:Flavobacterium更喜欢pH相对高的沙粒,促进CH4排放并抑制N2O和CO2产生;而Hydrogenophaga更喜欢营养丰富的细粒,促进N2O和CO2排放并抑制CH4产生。