基于高通量测序分析驴皮肤病病灶中细菌菌群组成

• 作者: 伊艳杰 刘阳 张慧茹 梁俊杰 樊坤 王佳奇 王子朝 王雪琴 白朋勋
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 驴皮肤病 高通量测序 细菌菌群组成 高丰度菌群
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 37-41
• 页数: 5页
• 分类号: S853.55|S852.611
• 字数: 3396字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2019.06.007

摘要

驴皮具有极高的药用价值,但驴皮肤病临床发病率较高,不仅影响驴生长速度,也明显降低驴皮质量.驴皮肤病主要发生在头部和背部,临床表现为脱毛、皮屑、出血等.从天津某养殖基地采集不同症状的驴皮肤病样本37个,从中挑选6份典型皮肤病样品,采用高通量测序分析其细菌菌群组成,为研究其发病机制和防治提供基础资料.结果 显示,在送检的6个样品中,发现存在4门、7纲、12目、19科、37属的细菌菌群.在属水平上,有Achromobacter、Stenotrophomonas、Pseudomonas为优势菌属,分别占总菌群的20.30％、15.00％和12.30％.通过PCoA和Venn图分析可知,皮肤出血、未出血病灶菌群组成明显不同;皮肤出血样品的菌群组成相似,Agrobacterium、Paenibacillus、Clostridium丰度较高;皮肤硬化菌群组成相似,Pantoea为主要菌群;多皮屑样品菌群组成有差异,Trichococcus是共有菌群.结果 表明,引起驴皮肤病的细菌菌群组成具有明显差异,可为后期发病机制和防治提供科学依据.