基于高通量测序鉴定慈姑黄化病病原

• 作者: 张驰 胡成慧 苏燕 邱静思 邹承武
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 慈姑黄化病 高通量测序 植原体 16SrRNA序列 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农业气象
• 页码范围: 578-584
• 页数: 7页
• 分类号: S436.45|S432.44
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.03.19

摘要

[目的]明确引致广西平乐县慈姑大面积黄化的主要病原物,为该病害的防治提供参考.[方法]从广西平乐县采集自然表现褪绿黄化症状的慈姑植株,分别提取其叶片和茎组织的总RNA,利用RNA-Seq高通量测序技术对其转录组进行测序,并对序列组装获得的重叠群(contigs)进行BLAST注释,筛选出注释为植原体16S rRNA序列的con-tigs,根据其序列设计引物Phy-F和Phy-R,以采集的褪绿黄化症状慈姑植株和无症状植株的叶片样本总DNA为模板,进行PCR鉴定.[结果]对扩增获得的长度为1.5 kb的DNA片段进行序列测定,从分子水平证实慈姑黄化病的病原为植原体(strain:AY-China).将测序获得的植原体16S rRNA序列与GenBank收录的15个植原体分组代表菌株的16S rRNA序列进行比对分析并构建系统发育进化树,发现AY-China与翠菊黄化植原体16SrI组(Aster yellows group:16SrI)聚类在同一分支,且各组代表菌株的16S rRNA序列相似性在88.3％～96.0％.进一步将AY-China与16SrI不同亚组代表菌株的16S rRNA序列进行多重比对并构建系统发育进化树,发现AY-China与翠菊黄化植原体16SrI-B亚组聚类到在一分支,且与16SrI-B亚组代表菌株的16S rRNA序列相似性高达99.5％,说明AY-China应属于16SrI-B亚组.[结论]广西平乐县慈姑黄化病病原为植原体,其隶属于翠菊黄化植原体16SrI-B亚组.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹承武	广西大学农学院	13	62	4.0	7.0
2	胡成慧	广西大学农学院	2	2	1.0	1.0
3	张驰		1	0	0.0	0.0
4	邱静思	广西大学农学院	2	2	1.0	1.0
5	苏燕	广西大学农学院	1	0	0.0	0.0