斑点叉尾 ipu-miR-143靶基因EB1的鉴定

• 作者: 唐刘秀 潘建林 葛家春 许志强 赵沐子
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 斑点叉尾 miR-143 EB1基因 靶基因
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 283-290
• 页数: 8页
• 分类号: S96
• 字数: 5297字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2014.00283

摘要

采用生物信息学方法对斑点叉尾(Ictalurus punctatus)ipu-miR-143的靶基因进行预测，并对预测到的ipu-miR-143靶基因进行生物学鉴定。生物信息学预测结果显示，斑点叉尾微管相关蛋白基因RP/EB家族EB1基因的3′-UTR区具有ipu-miR-143的潜在作用位点。结合对几种近缘物种中RP/EB家族EB1基因和miR-143的进化保守性进行分析，推测ipu-miR-143在斑点叉尾中可以通过靶向EB1基因的3′-UTR区而发挥其调控功能。因此，本研究将斑点叉尾 EB1基因的3′-UTR区(含有miR-143靶位点)构建到pMIR-REPORTTM Luciferase载体的下游，通过双荧光素酶报告基因检测系统对ipu-miR-143的靶基因进行鉴定。采用HEK293和CCK两种细胞进行细胞转染，两种细胞中转染 miR-143 mimics 组荧光相对活性与对照组相比均表现为显著性降低(P<0.05)。共转染miR-143 inhibitors 后， CCK 细胞中荧光素酶相对活性(8.27±1.02)与对照组相比(5.44±1.55)显著上调(P<0.05)；HEK293细胞中荧光素酶相对活性(6.30±1.19)与对照组(4.26±0.84)相比有所上升，但无显著性差异(P>0.05)。初步研究结果提示， miR-143可以通过靶向EB1基因的3′-UTR区而发挥其调控功能。本研究旨为后续深入研究斑点叉尾 EB1基因的转录后调控机制提供基础依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘建林	南京师范大学生命科学学院	3	66	2.0	3.0
2	许志强	南京师范大学生命科学学院	16	24	3.0	4.0
3	唐刘秀		4	28	2.0	4.0
7	葛家春	南京师范大学生命科学学院	4	44	2.0	4.0
8	赵沐子	南京师范大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0