旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 付宝权 刘静宜 孙树民 岳龙 曲自刚 李文卉 高小磊
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 旋毛虫 硫氧还蛋白过氧化物酶 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 331-339
• 页数: 9页
• 分类号: S852.731
• 语种: 中文

摘要

为了研究旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶的功能,对GenBank中旋毛虫基因组数据库和旋毛虫EST数据库进行检索,获得旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的cDNA序列并设计引物.以旋毛虫肌幼虫总RNA为模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到pMD18-T载体后测序并进行生物信息学分析.结果显示,成功克隆到3个旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的cDNA序列(TsTPx1,TsTPx2,TsTPx3).TsTPx1 cDNA含有1个由747个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码248个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质的理论分子质量为28.2 ku,理论等电点为9.00.TsTPx2 cDNA合有1个由588个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码195个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质理论分子质量为22.1 ku,理论等电点为6.52.TsTPx3 cDNA含有1个由594个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码197个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质理论分子质量为22.4 ku,理论等电点为6.08.TsTPx1、TsTPx2、TsTPx3都具有1个AhpC-TSA结构域和1个1-cys Prx_C结构域.同源性分析表明,TsTPx1、TsTPx2、TsTPx3与其他线虫硫氧还蛋白过氧化物酶的一致性在60％左右.