基于PCR-SSR的棉花外源染色体片段快速检测方法的建立与应用

• 作者: 吴嫚 喻树迅 宿俊吉 庞朝友 王成社 邓福军 陈红 马麒
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 海岛棉 陆地棉 染色体片段 SSR 置换系
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 研究资源与技术改进
• 页码范围: 632-641
• 页数: 10页
• 字数: 5951字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2014.05.012

摘要

外源染色体片段或基因的准确鉴定对作物遗传改良具有重要的作用.尽管分子标记己被广泛应用到外源染色体片段或基因的检测上,但是对于大群体中少数几个阳性植株的鉴定,逐个检测的效率极低.本研究以陆地棉(Gossypium hirsutum L.)新陆早48号与海岛棉(G.barbadense)染色体片段置换系CSSL-122的BC2F1群体147单株DNA样本为材料,通过构建二维矩阵排列DNA样本材料,分别对待测样本按行、列进行混合,获得m个行的混合样本和n个列的混合样本;以m=n=8矩阵为例,对待检m×n=64个样本行列混合获得16个混合样本并进行检测,根据检测结果在矩阵中推断确定含有外源染色体片段的阳性样本.结果表明,利用基于PCR-SSR技术构建矩阵混合池的检测方法,可以快速检测陆地棉背景中外源海岛棉染色体片段,逐个样本检测验证了其方法的准确性;统计学分析表明,阳性样本出现频率低于7.81％时,检测样本的节本率可保持在50％以上.基于PCR-SSR技术构建矩阵混合池检测方法的建立,为棉花外源染色体片段快速高效鉴定提供了新方法.