hMSC成骨分化相关lncRNA的筛选和初步鉴定

• 作者: 刘会文 曹凯 罗嘉全 邹学农 韩智敏 黄路
• 来源期刊: 中山大学学报（医学科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 人骨髓间充质干细胞 长链非编码RNA Smurf-1 成骨分化
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 230-236
• 页数: 7页
• 分类号: R781.5
• 字数: 4060字
• 语种: 中文

摘要

[目的]筛选和初步鉴定人骨髓间充质干细胞(hMSC)成骨分化相关的长链非编码RNA (lncRNA).[方法]利用Refeseq,UCSC knowngenes,Ensembl,H-invDB 7.0,RNAdb 2.0,NRED生物软件分析成骨基因相关的lncRNA,综合获得可能的成骨相关lncRNA;3例骨髓标本来源于行腰椎手术患者,密度梯度法分离扩增hMSC后,分成骨诱导组和对照组,地塞米松、维生素C、β-甘油磷酸钠诱导hMSC成骨分化,通过ALP测定及钙结节茜素红染色进行成骨诱导鉴定;qRT-PCR验证hMSC成骨分化前、后差异表达的lncRNA,以及成骨分化前、后差异表达的基因BMP1、MSX1、Runx2、Smurf-1、ALP.[结果]通过上述生物软件综合分析发现3个成骨基因MSX1、BMP1和Smurf1周围存在相关lncRNA.4个lncRNA (AK129811、AK024937、AK096529、uc003ups)与成骨基因Smurf-1相关;2个lncRNA(AF289591和uc003xbe)与成骨基因BMP1相关;1个lncRNA (AK056311)与成骨基因MSX1相关.ALP检测示:与对照组细胞相比,成骨诱导组细胞1周ALP值最高,达到(16.82±1.64)nmol/min,随着诱导时间的延长,ALP值逐渐降低,3周降至(8.37±1.01)nmol/min.钙结节染色显示hMSC成骨诱导分化2周后胞外开始出现少量钙结节,随着诱导时间延长钙结节数量逐渐增加,成骨诱导至第3周钙结节最多,定量测定钙质量浓度达(716±49)mg/mL.RT-qPCR结果显示绝大部分lncRNA在hMSC成骨分化过程中表达均下调,其中2个与Smurf-1相关lncRNA(AK096529和uc003ups)与成骨诱导前相比,存在显著性下调.1个与MSX1相关的lncRNA(AK056311)与成骨诱导前相比,也存在显著性下调.同时,成骨分化基因Runx2、ALP表达显著性上调,MSX1、Smurf-1表达显著性下调.[结论]结合既往研究结果分析:AK096529和uc003ups可能通过正向调控Smurf1,促使Smurf1下调,减少Runx2的降解,继而促进hMSC的成骨分化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹学农	中山大学骨科研究所	47	196	8.0	10.0
2	曹凯	南昌大学第一附属医院骨科	33	108	6.0	8.0
3	韩智敏	南昌大学第一附属医院骨科	41	219	7.0	13.0
4	罗嘉全	南昌大学第一附属医院骨科	4	18	2.0	4.0
6	刘会文	南昌大学第一附属医院骨科	3	21	2.0	3.0
7	黄路	江西省妇幼保健院儿童保健科	6	24	3.0	4.0