水稻籽粒性状的 SSR 关联分析

• 作者: 党小景 刘强明 洪德林 王卉 赵凯铭 陈氏秋江
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 籽粒性状 SSR 分子标记 关联分析 有利等位变异
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 243-257
• 页数: 15页
• 分类号: Q755|S511?032
• 字数: 8155字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2014.03.004

摘要

用262个 SSR 标记对来自不同生态区的540份水稻品种的基因组变异进行扫描,分析该自然群体的遗传多样性、群体结构和连锁不平衡位点,并采用 TASSEL 软件的一般线性模型(GLM)方法进行标记与性状的关联分析.结果表明：1)该自然群体由7个亚群体组成；每个亚群内,无论是共线 SSR 标记位点之间还是非共线 SSR 标记位点之间均存在一定程度的连锁不平衡.2)三年均检测到的与粒长显著相关的标记位点有45个,贡献率最高的是 RM5849(52．86％),M3766-140是增加表型效应最大的等位变异,载体品种是农香25.与粒宽显著相关的位点有7个,贡献率最高的是 RM17(63．61％),增加表型效应最大的等位变异是 RM17-145和 RM573-235,载体品种分别是宁粳恢338和早十日黄稻.与粒厚显著相关的位点有11个,贡献率最高的是 RM276(25．44％),增加表型效应最大的等位变异是 RM508-215和 RM7288-205,载体品种都是红芒沙粳.与千粒重显著相关的位点有6个,贡献率最高的是 RM17(32．17％),增加表型效应最大的等位变异是 RM17-145,载体品种是宁粳恢338.预测了利用这些载体材料改良籽粒性状的潜在杂交亲本组合.