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甜高粱4-香豆酸辅酶A连接酶基因(4CL)的克隆与鉴定及时空表达分析
甜高粱4-香豆酸辅酶A连接酶基因(4CL)的克隆与鉴定及时空表达分析
作者:
周华
周
娄来清
滕胜
王玉锋
蔡庆生
陈素丽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甜高粱
4-香豆酸辅酶A连接酶
木质素
时空表达
类黄酮
酶活性
基因克隆
摘要:
通过对木质素合成途径中关键的限速酶4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL,EC6.2.1.12)基因克隆、鉴定与时空表达分析来研究甜高粱4CL基因家族的特性,为今后利用基因工程手段改造甜高梁木质素提供一定的理论依据.搜索NCBI数据库得到高粱4CL基因家族序列,以甜高粱品种‘大力士’的cDNA为模板克隆得到甜高粱4CL家族中各蛋白编码序列(CDS),CDS连入表达载体pET51B,转入大肠杆菌表达菌株(BL21)进行诱导表达,镍柱纯化后进行酶活性分析.实时定量荧光PCR(qPCR)检测甜高梁4CL基因家族各成员在不同时期和不同组织中的相对表达量.结果表明:通过在NCBI数据库中对植物4CL蛋白序列分析,在高粱基因组中,鉴定出7个4CL类似(4CL-like)基因.序列对位排列分析显示:甜高粱7个4CL-like基因在高粱属中非常保守;其氨基酸序列与水稻相对应的Os4CL有90%左右的相似度;它们可分为4CL Class Ⅰ和4CL ClassⅡ两类,其中Sb07G007810、Sb04G005210、Sb10G026130、Sb07 G022040、Sb03G000610和Sb06G016630属于4CLClass Ⅰ,Sb04G031010属于4CL ClassⅡ.酶活性分析表明甜高粱7个4CL蛋白都具有4-香豆酸辅酶A连接酶活力.通过对甜高粱7个4CL基因时空表达分析发现,参与木质素合成的4CL Class Ⅰ类基因在组织生长快速期的表达量非常高,而参与类黄酮合成的4CL ClassⅡ类基因在植物受到太阳直接照射的部位表达量显著地增加.在根和茎中,Sb04G005210基因的表达量最高;在叶中,Sb07 G007810基因的表达量最高.上述甜高粱7个基因属于真正的4CL基因.
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基因家族
表达特性
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
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关键词热度
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文献信息
篇名
甜高粱4-香豆酸辅酶A连接酶基因(4CL)的克隆与鉴定及时空表达分析
来源期刊
南京农业大学学报
学科
生物学
关键词
甜高粱
4-香豆酸辅酶A连接酶
木质素
时空表达
类黄酮
酶活性
基因克隆
年,卷(期)
2014,(3)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
9-19
页数
分类号
Q946.5
字数
语种
中文
DOI
10.7685/j.issn.1000-2030.2014.03.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
蔡庆生
南京农业大学生命科学学院
40
631
14.0
23.0
2
周
南京农业大学生命科学学院
1
16
1.0
1.0
6
王玉锋
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
3
34
3.0
3.0
7
娄来清
南京农业大学生命科学学院
7
134
6.0
7.0
8
周华
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
10
137
6.0
10.0
9
陈素丽
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
2
16
1.0
2.0
10
滕胜
1
16
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传播情况
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2019(9)
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4-香豆酸辅酶A连接酶
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
南京农业大学学报
主办单位:
南京农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2030
CN:
32-1148/S
开本:
大16开
出版地:
南京市卫岗1号
邮发代号:
28-53
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
2940
总下载数(次)
5
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