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摘要:
目的 寻找8号染色体参与心脏发育的关键区域.方法 采用Affymetrix SNP芯片技术,对2例多发畸形新生儿病例进行全基因组拷贝数变异(CNVs)筛查,经过筛选得到罕见潜在致病性CNVs,将CNVs片段结合患儿的表型进一步与DECIPHER数据库、ISCA数据库中的病例信息进行比对.结果 (1)2例共检测到潜在致病性CNVs 11个,大小为546.6~27 892 kb,全部集中在8号染色体短臂,邻近的CNV合并后得到4个不同区域.例1的2个CNVs分别为8p23.3-8p23.1(387 912~11 506 771 bp)缺失和8p23.1-8p11.1(11 508 387~43 321 279 bp)重复;例2的2个CNVs分别为8p23.3-8p23.1(46 385 ~7 809 878 bp)缺失和8p23.1-8p11.2(12 260 914 ~40 917 092 bp)重复.(2)与数据库中的病例信息比对结果:例1为严重心脏畸形,其缺失的8p23.1的7 809 878 ~11 506 771 bp区域内包含心脏发育相关基因SOX7,重复区段内包含GATA4,荧光定量PCR验证例1的SOX7拷贝数低于正常,GATA4拷贝数高于正常.例2的SOX7和GATA4拷贝数正常.结论 8p23.1上7 809 878~ 11 506 771 bp区段与心脏发育异常相关,为参与心脏发育的关键区域,SOX7拷贝数减低、GATA4拷贝数增加可能为导致心脏畸形的原因之一.
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文献信息
篇名 以先天性心脏病为主要表现的8p缺失伴重复新生儿全基因组拷贝数变异分析二例
来源期刊 中华儿科杂志 学科
关键词 8p部分缺失 8p部分重复 基因组拷贝数变异 新生儿 先天性心脏病
年,卷(期) 2014,(6) 所属期刊栏目 临床研究与实践
研究方向 页码范围 460-463
页数 4页 分类号
字数 2981字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.0578-1310.2014.06.013
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 杨琳 复旦大学附属儿科医院新生儿科 65 253 9.0 14.0
2 梅枚 复旦大学附属儿科医院新生儿科 9 50 4.0 7.0
3 詹国栋 复旦大学附属儿科医院新生儿科 8 26 3.0 4.0
4 王慧君 5 9 2.0 3.0
5 马端 2 7 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
8p部分缺失
8p部分重复
基因组拷贝数变异
新生儿
先天性心脏病
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华儿科杂志
月刊
0578-1310
11-2140/R
16开
北京市西城区宣武门东河沿街69号
2-62
1950
chi
出版文献量(篇)
7133
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32
总被引数(次)
115621
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