野生大豆抗胞囊线虫基因SHMT的序列多样性

• 作者: 刘晓冬 王玉民 董英山 袁翠平 赵洪锟 齐广勋
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 野生大豆 大豆胞囊线虫 SHMT 序列多样性
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 品种资源
• 页码范围: 755-760
• 页数: 6页
• 分类号: S565.1
• 字数: 4323字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2014.06.010

摘要

大豆丝氨酸羟基转移酶(serine hydroxymethyltransferase)基因(SHMT)是Rhg4位点的抗胞囊线虫基因.本研究根据基因序列设计PCR引物对92份野生大豆进行了扩增,并对扩增产物测序,研究了其遗传多样性及其与大豆对胞囊线虫抗性的关系,旨在为野生大豆资源的合理利用提供参考.在供试的92份野生大豆SHMT序列(2 430bp)中,共发现了13个SNP位点(7个转换,6个颠换)和4个Indel(均发生在非编码区),其中11个为简约信息位点;SHMT序列多样性为π=0.000 61和θ=0.001 06;多态性位点形成16个单倍型,其中9个单倍型的分布频率＞2％,单倍型多样性为0.855;Tajima's D、Fu and Li's D和Z检验发现野生大豆SHMT不存在选择压力;卡方测验表明野生大豆SHMT与大豆对胞囊线虫的抗性没有直接关联;采用UPGMA法构建的SHMT分子进化树表明,供试92份野生大豆被聚类在6个类群,并表现出种质间的遗传关系与其生态区有一定的联系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵洪锟		34	230	7.0	14.0
2	董英山		58	417	11.0	18.0
3	袁翠平		15	76	3.0	8.0
4	王玉民		33	235	7.0	15.0
5	齐广勋		14	19	2.0	3.0
6	刘晓冬		17	46	4.0	6.0