免培养法对大鲵肠道微生物多样性的研究

• 作者: 丁小维 兰阿峰 杨曼 邓百万 郭素芬 顾东升
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: 免培养 大鲵 肠道微生物 多样性
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 兽医微生物
• 页码范围: 1342-1349
• 语种: 中文
• DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130568

摘要

[目的]了解大鲵肠道内生细菌的组成及多样性.[方法]采用美国Mo Bio公司试剂盒提取大鲵肠道内容物总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rRNA基因特异性扩增,构建大鲵肠道内容物内生细菌16S rRNA基因克隆文库,对阳性克隆进行限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,并对Hae Ⅲ酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树.[结果]根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的101个阳性克隆归为28个不同的可操作分类单元(OTUs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、梭菌门(Clostridia)、芽孢杆菌门(Bacilli)和衣原体门(Chlamydiae)4个门.其中,变形菌门(Proteobacteria,占克隆总数的92.08％)为最优势类群.序列比对结果表明这些克隆序列分别与已报道的20个属具有较高的相似性.此外,还有一个OTU在系统发育树上形成独立分支且未能确定其分类.[结论]大鲵肠道内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓百万	陕西理工学院生物科学与工程学院	111	874	17.0	22.0
3	丁小维	陕西理工学院生物科学与工程学院	23	171	8.0	12.0
5	兰阿峰	陕西理工学院生物科学与工程学院	18	45	5.0	6.0
9	郭素芬	陕西理工学院生物科学与工程学院	16	27	4.0	5.0
10	杨曼	陕西理工学院生物科学与工程学院	4	16	2.0	4.0