基于生物芯片检测结直肠癌相关基因的甲基化

• 作者: 侯煜杰 叶俊文 汪建平 汪普宁 王磊 谭淑云 陈伟 黄美近
• 来源期刊: 中山大学学报（医学科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 甲基化 结直肠癌 芯片 Opcml
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 信息研究
• 页码范围: 920-924
• 页数: 5页
• 分类号: R73
• 字数: 2500字
• 语种: 中文

摘要

[目的]应用微矩阵基因芯片技术筛选结直肠癌甲基化基因.[方法]分别提取6对结直肠癌组织和癌旁正常组织DNA,超声破碎及甲基化DNA富集后与甲基化芯片(NimbleGen human DNA Methylation 3×720K CpG)进行杂交,杂交信号经扫描等处理后采用生物信息学对检测结果进行分析.并对筛选出来的基因进行验证.[结果]一共发现有2 296个高甲基化基因,其中有293个基因无文献报道.生物信息学分析显示,所有的甲基化基因随机分布在24对染色体上.聚类分析结果显示,某些在细胞分裂和肿瘤发生发展中起重要作用的生理过程中存在大量甲基化差异基因,如DNA修复,细胞周期和侵袭等.初步验证发现,Opmcl基因在结直肠癌组织及癌旁正常组织中存在甲基化差异.[结论]在结直肠癌中运用DNA甲基化芯片进行甲基化基因筛查是一种有效的方法.