甘肃酒泉等地区豆科植物根瘤菌的遗传多样性和系统发育分析

• 作者: 刘磊 单辉辉 李正 韩素贞 齐雅琳
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 根瘤菌 16S rDNA PCR-RFLP分析 16S rDNA全序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 188-195
• 语种: 中文

摘要

采用16S rDNA PCR-RFLP和16S rDNA全序列分析技术对采集自甘肃酒泉、嘉峪关等8个地区的豌豆、菜豆等几个不同豆科植物根瘤中分离的53株供试菌株和9株参比菌株进行了遗传和系统发育分析.16S rDNA PCR-RFLP结果表明,在77.5％的相似性水平上全部供试菌株聚成5个分支.分支Ⅰ为Sinorhizhobium-Rhizobium分支,分支Ⅱ为Agrorhizobium-Bradyrhizobium分支,分支Ⅲ是未知供试菌组成的分支,分支Ⅳ为Mesorhizobium分支,分支Ⅴ为2株未知供试菌组成的分支.在89.8％的相似性水平上,分支Ⅰ包括2个亚分支:亚分支1由CNU1008等14株供试菌组成,与Sinorhizobium meliloti LISPA1002T菌株聚在一起;亚分支2包括6株未知菌,与Rhizobium leguminosarum USDA 2370T聚在一起.分支Ⅱ包括3个亚分支:亚分支1包括CNU 1041等4株菌,与2株Agrobacterium tumefaciens IAM 13129T和IAM 13569T聚在一起;亚分支2包括5株菌,与Bradyrhizobiumjaponicum USDA 6T菌株聚在一起;亚分支3包括3株未知菌.选取各分支和亚分支的代表菌株进行16S rDNA测序,结果表明,两种分析方法在结果上具有较好的一致性.处于分支Ⅰ的Sinorhizobium亚分支的菌株,与S.fredii和S.meliloti的相似性达到99％,该亚分支菌株的确切系统发育地位有待于DNA-DNA杂交来确定.处于分支Ⅰ的Rhizobium亚分支的菌株,与R.giardinii的相似性达到99％,与R.etli的相似性为98％.同样,该亚分支的确切地位有待于DNA-DNA杂交来确定.处于分支Ⅱ Agrobaterium亚分支的菌株与A.rubi的相似性达到99％.处于分支Ⅱ Bradyrhizobium亚分支的菌株,与B.liaoningense的相似性达到99％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘磊	首都师范大学生命科学学院	11	93	5.0	9.0
2	韩素贞	首都师范大学生命科学学院	15	107	4.0	10.0
3	齐雅琳	首都师范大学生命科学学院	3	4	2.0	2.0
4	李正	首都师范大学生命科学学院	4	29	2.0	4.0
5	单辉辉	首都师范大学生命科学学院	2	3	1.0	1.0