产电微生物基因调控网络的构建和特异性通路分析

• 作者: 丁德武 刘翠翠 孙啸 徐军 谢建明
• 来源期刊: 中国生物工程杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 产电微生物 胞外电子传递 基因转录调控网络 基因表达数据分析
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 计算生物学与生物信息学专辑
• 页码范围: 42-46
• 分类号: Q344
• 语种: 中文
• DOI: 10.13523/j.cb.20141106

摘要

研究产电微生物胞外电子传递过程和机制,发现与产电效率相关的关键基因、通路和代谢物,是微生物燃料电池研究中的关键技术.为了发现在胞外电子传递过程中起到关键作用的基因以及通路,首先利用比较基因组学的方法,以模式微生物大肠杆菌和同属希瓦氏菌的其他菌株为参考,构建了Shewanella.onedensis MR-1的全基因组基因转录调控网络,大大扩展了目前已知的基因调控关系.然后以此网络为基础,结合基于蛋白质相互作用分析得到的胞外电子传递通路,构建了与胞外电子传递直接传递密切相关的细胞色素C编码基因及其相关调控基因构成的子网络,结合全基因组基因表达数据,研究了特异性条件下胞外电子传递的可能通路和基因调控过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙啸	东南大学生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院	71	488	12.0	20.0
2	谢建明	东南大学生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院	50	187	7.0	10.0
3	徐军	东南大学生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院	25	98	6.0	8.0
4	刘翠翠	东南大学生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院	4	16	2.0	4.0
5	丁德武	东南大学生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院	2	9	2.0	2.0