赤子爱胜蚓Eisenstasin样蛋白cDNA和氨基酸序列分析

• 作者: 于保锋 刘志贞 张悦红 牛勃 王建华 程牛亮 解军
• 来源期刊: 山西医科大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 赤子爱胜蚓 Eisenstasin样蛋白 cDNA 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 251-254,339-340
• 页数: 6页
• 分类号: Q51
• 字数: 1725字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13753/j.issn.1007-6611.2014.04.001

摘要

目的 对赤子爱胜蚓Eisenstasin样蛋白cDNA序列和氨基酸序列进行综合分析,为其结构和功能的研究奠定理论基础.方法 从赤子爱胜蚓cDNA文库中随机测序获得目标cDNA序列,利用基因和蛋白质分析处理软件DNAMAN、NCBIORF finder、BLAST、Conserved Domains、GOR、SWISS-MODEL等软件对该目标的基因序列和氨基酸序列进行综合分析.结果 测序获得的赤子爱胜蚓Eisenstasin样蛋白cDNA序列长为565 bp,编码148个氨基酸残基,基因序列比对显示该蛋白与Eisenstasin I mRNA的编码序列同源度最高,两者核苷酸的相似度为78％ (148/190),氨基酸序列比对显示该蛋白与Eisenstasin Ⅱ的氨基酸序列同源度最高,两者氨基酸的相似度为37％ (61/166),目标序列中存在3段Antistasin家族保守结构域,二级结构和三级结构预测显示目标蛋白中主要存在β折叠和无规卷曲的结构,与Antistasin的预测结果高度相似. 结论 经多种生物软件分析,可以认为本次发现的Eisenstasin样蛋白与安德爱胜蚓组织中发现的Eisenstasin和水蛭中发现的Antistasin同源度高,可能具有抗凝功能.