川中丘陵地区大豆根瘤菌遗传多样性与系统发育关系

• 作者: 周欢 张思兰 徐开未 游芳 熊峰 陈远学
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 大豆根瘤菌 PCR-RFLP 16S rDNA glnⅡ nodC 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 分类
• 页码范围: 616-623
• 分类号: Q939
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.2014.06.003

摘要

[目的]研究分离自川中丘陵地区大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育.[方法]采用16S rDNAPCR-RFLP和16S rRNA基因、glnⅡ、共生基因(nodC)系统发育分析的方法进行研究.[结果]供试未知菌的16S rDNA用4种限制性内切酶(HaeⅢ、Hinf Ⅰ、Msp Ⅰ及Taq Ⅰ)酶切后获得5种16S遗传图谱类型.16SrDNA PCR-RFLP结果表明,所有供试菌株在83％水平分为慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和中华根瘤菌属(Sinonrhizobium)两大类群,而75％的菌株为中华根瘤菌.6个代表菌株的16S rDNA、glnⅡ和nodC三个位点基因的系统发育结果基本一致,4株与,S.fredii USDA205T相似度最高;有2株分别与B.yuanmingenseCCBAU10071T、B.diazoefficiens USDA110T相似度最高.4个Sinonrhizobium代表菌株16S rDNA、glnⅡ序列相似度分别为98.3％-99.9％、98.2％-100％,但它们的nodC基因序列完全相同.[结论]川中丘陵地区大豆根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,S.fredii为优势种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈远学	四川农业大学资源环境学院	53	615	14.0	21.0
2	徐开未	四川农业大学资源环境学院	39	432	11.0	18.0
3	熊峰	四川农业大学资源环境学院	1	4	1.0	1.0
4	张思兰	四川农业大学资源环境学院	1	4	1.0	1.0
5	游芳	四川农业大学资源环境学院	1	4	1.0	1.0
6	周欢	四川农业大学资源环境学院	1	4	1.0	1.0