寒地部分粳稻的遗传多样性及遗传结构分析

• 作者: 刘永巍 孙翊轩 孟昭河 徐正进 李春光 王继亮 程芳艳
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 粳稻 SSR标记 遗传多样性 遗传结构
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 649-654
• 页数: 6页
• 分类号: S511.2.2
• 字数: 5461字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1700.2014.06.002

摘要

利用SSR分子标记,对来自于不同选育单位的粳稻品种间的遗传多样性及群体遗传结构进行分析,推断品种间的亲缘关系,为未来育种的亲本选配提供依据.选取均匀分布于水稻12个连锁群的48对引物,对来自不同选育单位的36份水稻材料进行遗传多样性和遗传结构分析.遗传多样性结果表明:48对引物中27对具有多态,占引物总数的56％.共检测出65个等位变异,有多态性的单个引物检测等位位点数为2～5个,平均等位基因数(Na)为2.4个.平均遗传多样性指数(He)为0.307,变幅为0.050～0.662.平均多态性信息含量(PIC)为0.263,变幅为0.053～0.588,平均Shannon-weiner指数为0.514,变幅为0.127～1.168.供试品种间的遗传相似系数介于0.38～1.00之间,平均为0.77.遗传相似系数在0.71～0.86占总数的68.4％; 0.71以下占总数的19％;0.86以上占总数的12.5％.并绘制聚类树状图.基于Structure模型的遗传结构分析把供试材料分为5个遗传结构群:群Ⅰ、群Ⅱ、群Ⅲ、群Ⅳ和群Ⅴ,类群间的遗传一致度变幅为0.7642(群Ⅰ和群Ⅳ)～0.9303(群Ⅲ和群Ⅴ),遗传距离变幅为0.0719(群Ⅲ和群Ⅴ)～0.269(群Ⅰ和群Ⅳ).群组间聚类将5个类群分为3大类,群Ⅲ和群Ⅴ以及群Ⅱ聚为一大类,群Ⅲ和群Ⅴ首先聚为一类,群Ⅰ与群Ⅳ各自成为一类.可见,同一单位选育的品种,亲缘关系较近,材料间总体遗传基础狭窄.建议黑龙江水稻育种者在未来亲本选配时尽量选择其他单位或地区育成的品种,以丰富选育品种的遗传多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐正进	沈阳农业大学水稻研究所	198	3835	31.0	51.0
2	李春光	黑龙江省农垦科学院水稻研究所	95	391	10.0	17.0
3	王继亮	黑龙江省农垦科学院作物开发研究所	36	84	5.0	8.0
4	刘永巍	黑龙江省农垦科学院水稻研究所	51	296	9.0	16.0
5	孟昭河	黑龙江省农垦科学院水稻研究所	36	287	8.0	16.0
6	程芳艳	沈阳农业大学水稻研究所	30	73	5.0	7.0
8	孙翊轩	黑龙江省农垦科学院水稻研究所	17	19	2.0	4.0