利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性

• 作者: 张立娜 曹桂兰 韩龙植
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 粳稻 地方品种 遗传多样性 遗传结构
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 405-413
• 分类号: S511.22
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.03.001

摘要

[目的]通过中国粳稻地方品种的遗传多样性分析,阐明各省份粳稻地方品种的遗传结构及其亲缘关系,为中国粳稻杂交育种的亲本选配提供科学依据.[方法]利用43对SSR多态性标记,对原产于中国17个省(市、自治区)的187份粳稻地方品种进行等位基因多样性、遗传结构和聚类分析.[结果]共检测到等位基因351个,每个位点等位基因变幅为2-21,平均每个位点等位基因数为8.2;基因多样性指数变异范围为0.117-0.908,平均为0.550;多态信息含量(PIC)变异范围为0.114-0.902,平均为0.523.在RM72、RM241、RM219、RM412和RM232等位点所检测到的遗传多样性参数值较大.西南、华南、华中粳稻地方品种的遗传多样性明显高于华北和东北地区;云南省粳稻地方品种遗传多样性最丰富,天津和吉林的粳稻地方品种的遗传多样性相对较低.基于Nei's遗传距离的系统聚类把供试材料分为8个小类群,南方粳稻地方品种主要聚类于第i、ii、iii、iv和v等5个小类群,北方粳稻地方品种主要聚类于第vi、vii和viii等3个小类群.基于模型的群体结构分析,供试材料被分为11个亚群,有144份材料被分到相应的11个亚群,其余43份材料被分到混合亚群.[结论]南方稻区粳稻地方品种的遗传多样性明显高于北方稻区,其中西南稻区的粳稻地方品种遗传多样性最为丰富,而云南是粳稻地方品种遗传多样性最丰富的省份.北方与南方粳稻地方品种间存在较大的遗传差异,粳稻地方品种间亲缘关系与地域性存在一定的相关性,这种相关性在北方粳稻地方品种中更为突出.RM72、RM241、RM219、RM412和RM232适合应用于粳稻地方品种的遗传多样性检测.