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摘要:
目的:初步评价15个可变串联重复序列(VNTR)位点对结核分枝杆菌临床分离株的分型能力,寻找适合湖州地区结核分枝杆菌基因分型的位点。方法2011年1-4月连续收集湖州地区结核分枝杆菌临床分离株,采用多位点数目多位点串联系复序列(MLVA)分析方法,对15个VNTR位点进行基因多态性检测,分析单个位点以及15个位点组合的基因分型能力(Hunter-gaston指数,HGDI)。结果分辨率较好的多态性位点有2个:Mtub-21和Mtub -39;分辨率中等的多态性位点共7个:ETR-A,ETR-C,MIRU -10,MIRU -23, MIRU-27,MIRU-40和Mtub-30;分辨率较差的多态性位点有6个:ETR-B,ETR-D,ETR-E,MIRU-16和MIRU-26和MIRU-39。通过计算,本次研究运用15个位点进行基因分型的 HGDI 为0.99,分辨能力好。结论 VNTR位点对结核分枝杆菌基因的分辨力较好,但还需继续寻找其他丰富多态性的VNTR位点,以便快速分型,提高分辨力。
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文献信息
篇名 VNTR位点对结核分枝杆菌基因分型的研究
来源期刊 浙江预防医学 学科 医学
关键词 结核分枝杆菌 基因分型 重复序列
年,卷(期) 2014,(3) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 221-223,228
页数 4页 分类号 R378.91+1
字数 1960字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张思潮 29 95 6.0 8.0
2 董正全 32 134 7.0 10.0
3 杨中荣 29 143 7.0 10.0
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结核分枝杆菌
基因分型
重复序列
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预防医学
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1007-0931
33-1400/R
大16开
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1989
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