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VNTR位点对结核分枝杆菌基因分型的研究
VNTR位点对结核分枝杆菌基因分型的研究
作者:
张思潮
杨中荣
董正全
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
结核分枝杆菌
基因分型
重复序列
摘要:
目的:初步评价15个可变串联重复序列(VNTR)位点对结核分枝杆菌临床分离株的分型能力,寻找适合湖州地区结核分枝杆菌基因分型的位点。方法2011年1-4月连续收集湖州地区结核分枝杆菌临床分离株,采用多位点数目多位点串联系复序列(MLVA)分析方法,对15个VNTR位点进行基因多态性检测,分析单个位点以及15个位点组合的基因分型能力(Hunter-gaston指数,HGDI)。结果分辨率较好的多态性位点有2个:Mtub-21和Mtub -39;分辨率中等的多态性位点共7个:ETR-A,ETR-C,MIRU -10,MIRU -23, MIRU-27,MIRU-40和Mtub-30;分辨率较差的多态性位点有6个:ETR-B,ETR-D,ETR-E,MIRU-16和MIRU-26和MIRU-39。通过计算,本次研究运用15个位点进行基因分型的 HGDI 为0.99,分辨能力好。结论 VNTR位点对结核分枝杆菌基因的分辨力较好,但还需继续寻找其他丰富多态性的VNTR位点,以便快速分型,提高分辨力。
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文献信息
篇名
VNTR位点对结核分枝杆菌基因分型的研究
来源期刊
浙江预防医学
学科
医学
关键词
结核分枝杆菌
基因分型
重复序列
年,卷(期)
2014,(3)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
221-223,228
页数
4页
分类号
R378.91+1
字数
1960字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张思潮
29
95
6.0
8.0
2
董正全
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7.0
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3
杨中荣
29
143
7.0
10.0
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引证文献(1)
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研究主题发展历程
节点文献
结核分枝杆菌
基因分型
重复序列
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
预防医学
主办单位:
浙江省预防医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1007-0931
CN:
33-1400/R
开本:
大16开
出版地:
浙江省杭州市滨江区滨盛路3399号
邮发代号:
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
11958
总下载数(次)
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