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摘要:
目的:分析湖北松滋地区湖北钉螺小尺度景观群体的遗传结构。方法选择 T 6-17、P101、D11、B14、T 4-33和C22等6对微卫星位点对松滋地区10个生境的湖北钉螺群体进行基因扫描,计算各群体的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)、观察杂合度(Ho)、多态信息含量(PIC)、群体间的遗传分化系数(FST )和遗传距离,根据遗传距离进行聚类分析,并进行分子变异方差分析(AMOVA)。结果10个钉螺群体经鉴定螺壳分为光壳和肋壳(包括浅肋和深肋),10个群体共检测到141个等位基因,各位点20-34个不等,平均每个位点检测到23.5个;6个微卫星位点的平均有效等位基因数为1.575,各位点的有效等位基因数并不平衡,且数值差异较大,范围从0.445至3.060。群体的平均 H o范围为0.438-0.698,在光壳的团山村群体中最低,在深肋型的马木口村群体中最高;群体的平均H e范围为0.589-0.892,在浅肋型的德胜村群体中最低,在深肋型的马木口村群体中最高;成对群体间的Fst为-0.01564-0.25247,各群体的PIC为0.528-0.857,显示出高度多态性;AMOVA 分析结果显示,变异主要存在于个体间,占总变异的88.4%;聚类分析结果显示,肋壳的马木口村、横堤村、义兴村三个群体与光壳的马狮子咀村、民主村、土桥村三个群体先聚为一支后,与浅肋的德胜村、木天河村两个群体与光壳的团山村、夹马槽村聚的一支合聚。结论松滋地区不同景观环境下湖北钉螺呈现不同螺壳形态,尽管遗传多样性较为丰富,但遗传变异主要来自个体间,不同螺壳形态的湖北钉螺群体间并未体现出明显的遗传分化。
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文献信息
篇名 基于微卫星标记的不同壳型湖北钉螺小尺度景观群体遗传结构研究
来源期刊 中国人兽共患病学报 学科 医学
关键词 微卫星DNA 湖北钉螺 小尺度群体遗传结构
年,卷(期) 2014,(7) 所属期刊栏目 论 著
研究方向 页码范围 701-708
页数 8页 分类号 R383.2
字数 4565字 语种 中文
DOI 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2014.07.009
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序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 尤平 陕西师范大学生命科学学院 23 122 5.0 10.0
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微卫星DNA
湖北钉螺
小尺度群体遗传结构
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中国人兽共患病学报
月刊
1002-2694
35-1284/R
大16开
福建省福州市津泰路76号
34-46
1985
chi
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