生物钟周期基因2与胰腺导管腺癌预后的相关性分析

• 作者: 刘孟刚 刘宏鸣 曾玮 杨俊涛 蓝翔 袁涛 谢斌 陈平
• 来源期刊: 中华消化杂志
• 关键词: 胰腺导管癌 PER2 预后 分子机制
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 论 著
• 页码范围: 616-619
• 页数: 4页
• 字数: 2040字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-1432.2014.09.009

摘要

目的寻找胰腺导管腺癌（PDAC）预后相关基因并探讨其分子调控机制。方法从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库中选取102例包含完整临床生存资料的 PDAC 患者的基因表达谱数据。从 Transfac 数据库中收集到106个转录因子调控基因集合。使用 PicTar 和 TargetScanS 算法收集到715个 miRNA 靶向调控基因集合。生物学通路数据来源于京都基因与基因组百科全书（KEGG）。已知癌基因数据来自癌基因普查（CGC）数据库。使用单因素 Cox 比例风险模型分析基因表达谱数据与生存时间的相关性，得到全基因组范围内的与生存相关的候选基因。使用超几何分布算法分析3种数据集的基因富集情况。使用 BH-FDR 算法进行多重矫正检验（要求假阳性率＜0．05）。采用 Kaplan-Meier 法对 PDAC 患者进行生存曲线分析。结果单因素 Cox 比例风险模型分析102例PDAC 患者数据后显示，有273个基因与患者的生存时间显著相关（P ＜0．0001）。将273个生存基因针对106个转录因子调控基因集合进行富集分析，得到12个富集生存基因的转录因子靶基因集合。将273个生存基因针对715个 miRNA 靶向调控基因集合进行富集分析，得到11个富集生存基因的miRNA 靶向调控基因集合。将273个生存基因针对 KEGG 通路数据进行富集分析，得到15个富集生存基因的生物学通路。生物钟周期基因2可能在转录水平受到转录因子 CCAAT 框/增强子蛋白（CEBPA）的调控，同时在转录后水平受到 miRNA-32的调控，进而通过昼夜节律通路影响 PDAC 的预后。102例 PDAC 患者按生物钟周期基因2表达量从高到低排序，前51例归为生物钟周期基因2高表达组，其余归为生物钟周期基因2低表达组，行 Kaplan-Meier 生存分析后显示，生物钟周期基因2与PDAC 的预后显著相关（P ＜0．01）。结论CEBPA/miRNA-32/生物钟周期基因2及其相关的生物钟节律通路可能是干预 PDAC 发展的靶通路，与 PDAC 预后相关。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢斌	第三军医大学第三附属医院肝胆外科	39	166	6.0	10.0
2	曾玮	第三军医大学第三附属医院肝胆外科	5	6	2.0	2.0
3	刘孟刚	第三军医大学第三附属医院肝胆外科	32	137	6.0	10.0
4	刘宏鸣	第三军医大学第三附属医院肝胆外科	39	232	9.0	13.0
5	袁涛	第三军医大学第三附属医院肝胆外科	47	232	7.0	13.0
6	杨俊涛	第三军医大学第三附属医院肝胆外科	32	116	6.0	9.0
7	蓝翔	第三军医大学第三附属医院肝胆外科	7	10	2.0	2.0