水稻航天诱变突变体全基因组测序研究

• 作者: 向跃武 张志勇 张志雄 王平 蒲志刚 蔡平钟
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 突变体 野生型 全基因组测定 SNP InDel SV
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 469-475
• 页数: 7页
• 分类号: S511
• 字数: 3374字
• 语种: 中文

摘要

将航天诱交突变体和野生型水稻材料进行全基因组测定,以已经完成全基因组测定的籼型水稻9311基因组序列为对照,利用SOAPsnp、SOAPindel和SOAPsv软件对序列进行SNP、InDel和SV等分析.结果发现野生型中出现SNPs 348966个,插入缺失片段(1～5 bp)62 298个,结构变异9962个;突变体材料中出现SNPs452173个,插入缺失片段(1～5 bp)66 977个,结构变异10336个.分析表明航天诱变因子对水稻基因组的诱变作用基本上平均分布,它与各对染色体的大小呈正相关.突变体中发生的诱变类型是SNPs＞ InDel＞ SV,表明航天诱变因子对水稻基因组中单碱基的改变为主要因素.本研究为探索航天诱变规律和更全面利用突交体资源奠定基础,为水稻功能基因研究和杂交水稻新资源的利用作出贡献.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒲志刚	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	37	398	10.0	19.0
2	王平	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	44	142	7.0	9.0
3	张志勇	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	24	117	6.0	10.0
4	蔡平钟	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	33	250	7.0	14.0
5	向跃武	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	31	146	6.0	10.0
6	张志雄	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	23	117	6.0	10.0