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摘要:
目的:发掘与岗梅乌索烷型三萜皂苷生物合成相关的酶基因。方法:利用Illumina测序平台对岗梅根进行转录组测序,通过基因注释、同源分析、系统发生分析等生物信息学手段,发掘可能参与合成的单基因簇(Unigenes)。结果:在岗梅根转录组中发现了272条与萜类生物合成相关的Unigenes。这其中包括72条可能参与萜类生物合成上游途径的Unigenes,以及26条可能与三萜合成途径下游母核合成、氧化和糖基化相关的Unigenes。对其中部分Unigenes进行系统发生分析,进一步揭示了这些Unigenes与同源基因间的进化关系。利用酵母表达系统,鉴定了两个香树酯醇合酶IaAS1和IaAS2,其中IaAS1为少数以α-香树脂醇为主要产物的香树酯醇合酶之一。结论:本文从岗梅根转录组数据库中发掘到一系列可能与岗梅乌索烷型三萜皂苷生物合成相关的酶基因。对这些基因的进一步研究,有助于从分子水平揭示岗梅中乌索烷型三萜皂苷的生物合成途径。
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文献信息
篇名 岗梅转录组及其乌索烷型三萜皂苷生物合成相关酶基因的发掘
来源期刊 世界科学技术-中医药现代化 学科 医学
关键词 岗梅 转录组 三萜皂苷 生物合成 基因发掘
年,卷(期) 2014,(7) 所属期刊栏目 专利信息资源研究
研究方向 页码范围 1505-1512
页数 8页 分类号 R282.5
字数 4926字 语种 中文
DOI 10.11842/wst.2014.07.011
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陈蔚文 广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心/岭南中药资源教育部重点实验室 170 2057 25.0 38.0
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岗梅
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三萜皂苷
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基因发掘
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