基于第二代测序的大鳞副泥鳅生长相关SNP标记的开发

• 作者: 凌去非 叶竹青 朱鹏飞 李彩娟 王国成 葛辰 韩晓飞
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大鳞副泥鳅 高通量测序 SNP 多态性标记 引物设计
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 21-27
• 页数: 7页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4155字
• 语种: 中文

摘要

大鳞副泥鳅是鳅科重要经济鱼类,通过Illumina HiSeq 2000测序平台对2个大鳞副泥鳅样本的转录本进行了高通量测序,其中AB2011M-1是群体中生长较快的10尾鱼的混合转录本,AB2011M-2是生长较慢的10尾鱼的混合转录本。通过对以上2个混合转录本的测序,分别获得了65536和80786个单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphisms,SNP)突变；对2个测序样本进行表达差异的比较,获得了39个表达差异基因。随机选取120个位点设计引物,进行验证分析,共获得16个有效的多态性标记。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	凌去非	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	82	609	13.0	20.0
2	朱鹏飞	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	6	31	4.0	5.0
3	王国成	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	6	29	4.0	5.0
4	李彩娟	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	20	61	4.0	7.0
5	葛辰	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	4	23	3.0	4.0
6	叶竹青	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	5	26	3.0	5.0
7	韩晓飞	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	7	38	4.0	6.0