4种大型水母类ITS-5.8S rDNA序列分析及其在钵水母类系统分析中的应用

• 作者: 孙明 李玉龙 王彬 王文波 董婧
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 钵水母 ITS-5.8S rDNA 长度多态性 物种鉴定 系统关系
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1278-1288
• 页数: 11页
• 分类号: S917
• 字数: 6500字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2015.15038

摘要

由于钵水母类生物地理学研究的缺乏以及不同时期形态变异较大等原因,对其分类鉴定比较混乱和困难.为弥补形态学分类的缺陷,采用通用引物PCR扩增法,测定了分布于黄海北部和辽东湾海域海蜇(Rhopilema esculentum)、沙蜇(Nemopilema nomurai)、海月水母(Aurelia sp.)、白色霞水母(Cyanea nozakii)4种大型水母的ITS-5.8SrDNA序列,同时利用GenBank数据库中已有的钵水母纲(Scyphomedusae) ITSl(the Ribosomal First Internal Transcribed Spacer)同源序列对其进行序列分析并构建系统树,分析ITS1序列片段在大型水母种类鉴定方面的可行性及其在钵水母类系统及演化中的应用.结果显示,4种水母的ITS-5.8S rDNA序列变异较大且具有明显的序列长度多态性,序列长度范围675～833 bp.钵水母纲很多种类的ITS1序列具有种内长度多态性现象,这种长度多态性主要是由于微卫星重复次数不同所造成的.钵水母纲科间遗传距离为0.295～0.491,种间遗传距离为0.024～0.812;除白色霞水母和海蜇外,种内个体间遗传距离为0.000～0.099.采用ML法(maximum likelihood)和贝叶斯法(Bayesian)构建的分子系统树拓扑结构不完全相同且与形态分类学的观点不太一致.研究表明,ITS基因序列在钵水母纲不同阶元间变异较大,适合于钵水母纲种类鉴定和属内种间水平的系统进化研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王文波	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	16	209	9.0	14.0
2	董婧	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	51	650	16.0	22.0
3	孙明	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	13	159	8.0	12.0
4	王彬	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	18	182	8.0	13.0
5	李玉龙	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	14	45	4.0	6.0