坛紫菜5.8S rDNA和ITS区片段的序列分析及应用

• 作者: 刘冰 徐燕 纪德华 谢潮添 陈昌生
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 农学
• 关键词: 坛紫菜 rDNA ITS 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 资源环境与生物技术
• 页码范围: 540-545
• 页数: 6页
• 分类号: S6
• 字数: 3179字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2007.05.020

摘要

对坛紫菜(Porphyra haitanensis)野生(GL)和栽培(PXV)品系的5.8S rDNA-ITS兀区进行了PCR扩增和序列分析,扩增的GL和PXV的DNA片段长度分别为1213 bp和1221bp,包含完整的ITS1-5.8S-ITS2区.然后对紫菜7个种9个品系(其中6种7个品系从GenBank数据库中获得)的rDNA相应序列进行了排序和系统进化分析,结果表明:9个紫菜品系rDNA中5.8S区的长度和序列非常保守,而ITS区的长度和序列则变异较大;根据它们的序列差异,计算出这9个紫菜品系的遗传距离在0.010～0.551之间,遗传相似性在44.9%～99%之间;并且采用邻接法构建了这9个紫菜品系的系统发育树,发现可以明显分为4个进化枝,由此讨论了分子分类方法同传统分类方法的分歧.实验结果表明,5.8S rDNA.ITS区序列可以成为紫菜种质鉴定和系统进化研究的强有力工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈昌生	集美大学水产学院	82	1194	18.0	30.0
2	纪德华	集美大学水产学院	62	860	15.0	26.0
3	谢潮添	集美大学水产学院	58	735	14.0	25.0
4	徐燕	集美大学水产学院	52	521	13.0	20.0
5	刘冰	集美大学水产学院	2	15	2.0	2.0