1株快速增殖的HAV分离株基因型分析

• 作者: 侯俊 姜棋予 李瑞生 杨瑞创 柴燕涛 白冰珂 胡燕 邬顺全
• 来源期刊: 传染病信息
• 学科: 医学
• 关键词: 序列分析 甲型肝炎病毒 基因型
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 155-159
• 页数: 5页
• 分类号: R373.21
• 字数: 3445字
• 语种: 中文

摘要

目的 确定1株快速增殖HAV临床分离株HAV302的基因型及其特点.方法 提取培养病毒RNA模板,通过反转录-聚合酶链反应技术扩增该病毒编码区基因并行序列测定,随后利用序列分析软件对其进行序列分析和基因型比对.结果 HAV302株VP1/2A区基因序列与GenBank中收录的HAV Ⅰ型中的ⅠB亚型MBB株核苷酸同源性最高(99.4％).进化树分析显示,HAV302株与MBB株亲缘最近.与MBB株相比,非结构蛋白编码区中的2B和2C区在整个病毒的编码区中变异最大.结论 HAV302株属于HAV Ⅰ型中的ⅠB亚型,其2B和2C区的变异可能是导致病毒快速增殖的原因之一.