预测及分析长链非编码RNA HOTAIR的分子调控通路

• 作者: 程立 胡先平 陈立彩 马锐
• 来源期刊: 湖北医药学院学报
• 关键词: 同源盒基因转录反义RNA 长链非编码RNA 生物信息学 肺部肿瘤
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 分子生物学
• 页码范围: 16-22
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13819/j.issn.1006-9674.2015.01.004

摘要

目的:预测及分析长链非编码RNA HOTAIR的分子调控通路.方法:运用UCSC Genome Browser、Lnc-Base、miRTarBase、JASPAR等数据库对长链非编码RNA HOTAIR(HOX transcript antisense RNA)的上游转录因子、.下游靶miRNA及靶miRNA的靶基因进行生物信息学预测及分析,并进一步推导其分子调控通路.结果:HOTAIR受上游SP1、FOXD1、USF1、SPIB等转录因子的调控,其能调控下游miR-326的表达,SMO、NOTCH1、NOTCH2、CD9与HOTAIR的转录因子存在相互作用,形成一个反馈调控通路.结论:生物信息学预测分析显示xxx-xxx-xxx信号轴(或网络)可能是xxx的重要分子机制,为进一步研究长链非编码RNA功能机制提供新思路.