广东省不同亚型 AIDS 病人 HIV-1 gp120 V3环基因变异及其利用辅助受体的情况

• 作者: 肖桂娥 蔡卫平 钟剑波 饶嫚 魏绍静
• 来源期刊: 中国艾滋病性病
• 学科: 医学
• 关键词: 艾滋病病毒Ⅰ型 辅助受体 V3环顶端四肽 CCR5 CXCR4
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 354-357
• 页数: 4页
• 分类号: R512.91|R373.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13419/j.cnki.aids.2015.05.02

摘要

目的 了解广东省艾滋病病毒(HIV)主要流行亚型及V3环氨基酸的变异特点,并分析病毒株利用辅助受体的情况.方法 收集2013-2014年期间,在广州市第八人民医院住院的艾滋病(AIDS)病人的血浆256份,巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)方法扩增env基因C2-C3(HBX2:6972～7365)区并直接测序,用Geen tool软件将基因序列翻译为氨基酸序列进行比对和分析.结果 共有214例(83.6％)扩增成功,其中143例(66.8％)为CRF01_AE;45例(21.0％)为B/C重组型;26例(12.1％)为CRF01_AE/B亚型.V3环顶端四肽基序,73.4％(157/214)为GPGQ,11.7％(25/214)为GPGR,8.9％(19/214)为GPGK,2.3％(5/214)为GQGQ,其他为(GPGG、GLGH、GPGS、GPGH)3.7％(8/214).使用国际上普遍应用的4种软件(PSSMx4r5、SAAC+ BLAS、PSSMsisi、Geno2pheno)分别对V3环顶端四肽基序利用辅助受体的情况进行评估.综合评估结果显示,132例(61.7％)利用CCR5,67例(31.3％)利用CXCR4.在15例(7.0％)无辅助受体评估结果的病例中,14例为CRF01_AE,1例为CRF01_AE/B.研究还发现,71.1％ (32/45)B/C重组型的V3四肽基序单一使用PSSMsisi软件的评估结果,与4种软件综合评估结果的一致率为100％.结论 目前广东省HIV-1的主要流行株仍是CRF01_AE,其V3环氨基酸高度变异,顶端四肽基序主要是GPGQ.对毒株利用辅助受体的情况,宜采取国际普遍使用的4种软件进行综合分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡卫平		11	13	2.0	2.0
2	肖桂娥		2	17	1.0	2.0
3	饶嫚		2	17	1.0	2.0
4	钟剑波		2	17	1.0	2.0
5	魏绍静		1	0	0.0	0.0