松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90基因结构特征及其分子进化

• 作者: 叶建仁 许剑涛 黄麟
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 松材线虫 拟松材线虫 多态性 同义密码子 分子进化
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 专题报道
• 页码范围: 11-16
• 页数: 6页
• 分类号: S763|Q781
• 字数: 5362字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2015.01.001

摘要

转录组的多态性是探讨物种多样性与分子进化的重要方面.笔者选取物种间保守性较高的HSP70、HSP90蛋白作为研究对象,探讨二者在松材线虫和拟松材线虫基因组中的结构差异,探明他们在松材线虫和拟松材线虫中的特点,并试图揭示两种线虫的系统发育关系.结果表明二者内含子具有丰富的多态性,内含子中的G+C含量也显著不同.核酸序列gABG和gmc2分别编码松材线虫和拟松材线虫HSP70的642个氨基酸,相似性高达99％,仅存在9个氨基酸的差异,并且这种差异是由13个碱基的多态性造成的.gSBO和gmc19分别编码松材线虫和拟松材线虫的HSP90,其氨基酸序列相似性为92％.对同义密码子的偏好性分析表明,17种氨基酸对应的58个密码子中,gSBG和gmc2存在10个密码子差异,gABO和gmc19存在5个密码子差异.采用邻接法分别构建的系统进化树表明松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90在系统发育关系上最为接近,并与其他线性动物门物种高度同源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶建仁		7	68	3.0	7.0
2	黄麟		2	1	1.0	1.0
3	许剑涛		1	1	1.0	1.0