低温胁迫下鹅掌楸抗寒性相关基因的差异表达分析

• 作者: 李斌 郑勇奇 陆畅
• 来源期刊: 植物资源与环境学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鹅掌楸 低温胁迫 抗寒性相关基因 数字基因表达谱 差异表达基因 相对表达量
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 页码范围: 25-31
• 页数: 7页
• 分类号: Q948.112+.2|Q946-33|S792.21
• 字数: 5594字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7895.2015.03.04

摘要

对4℃和-30℃低温条件下引种自安徽大别山的1株鹅掌楸[Liriodendron chinense(Hemsl.)Sarg.]植株顶芽总RNA进行了数字基因表达谱构建和差异表达基因筛选,并对筛选出的抗寒性相关基因进行了实时荧光定量PCR分析.结果表明:获得的总RNA样品质量符合实验要求.数字基因表达谱分析结果表明:每个样品的质量控制后序列的总长度均在0.5 Gbp以上,碱基错误率为0.01％,Q20值超过99％,Q30值为96.99％～97.23％,GC含量为44.97％～47.06％,并且每个样品比对成功的序列条数占质量控制后序列总数的百分率均在90％以上.差异表达基因筛选结果显示:共发现9个与鹅掌楸抗寒性有关的差异表达基因,分别为HSP、MYB、NAC、AP2、Zincfinger、WRKY、FAD、Phospholipase和β-amylase基因.实时荧光定量PCR分析结果表明这9个基因共有3种表达模式,其中,HSP和FAD基因的相对表达量均随着温度的降低而减少,表现为基因下调表达;AP2、NAC和Zinc finger基因的相对表达量随着温度的降低而增多,表现为基因上调表达;而β-amylase、WRKY、Phospholipase和MYB基因的相对表达量则表现为4℃时增加、-30℃时减少.从基因的相对表达量来看,最大相对表达量超过5的基因有NAC和WRKY,介于2～5之间的基因有AP2、Zinc finger、β-amylase和MYB,低于2的基因有Phospholipase、HSP和FAD.结果显示NAC和WRKY基因可能在鹅掌楸的抗寒过程中起主要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆畅	国家林木遗传育种重点实验室中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室	1	10	1.0	1.0
2	李斌	国家林木遗传育种重点实验室中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室	1	10	1.0	1.0
3	郑勇奇	国家林木遗传育种重点实验室中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室	2	13	2.0	2.0