鹅掌楸AOX家族基因克隆与组织表达分析

• 作者: 宗亚仙 李火根 温少莹 王曦 郝自远
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 鹅掌楸 交替氧化酶 基因克隆 生物信息学分析 组织表达
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传与育种
• 页码范围: 988-997
• 页数: 10页
• 分类号: Q943
• 字数: 5858字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201906037

摘要

鹅掌楸(Liriodendron chinense)为重要的珍贵用材及园林观赏树种,开展抗逆基因的研究,对于提高鹅掌楸适应性有重要意义.该文以鹅掌楸为研究对象,通过采用RT-qPCR与RACE相结合的方法克隆获得3个AOX基因,其ORF长分别为858、1032、1044 bp,相应编码氨基酸数为285、343、347 aa,分别命名为LcAOX1a、LcAOX1b和LcAOX2.蛋白同源性分析发现鹅掌楸AOX家族蛋白序列高度保守,尤其在C端保守性极高,且均含有"EXXH"、"EEE-Y"铁离子结合保守结构域.亚细胞定位分析结果显示LcAOX1a蛋白定位于线粒体及叶绿体之外的其他位置,LcAOX1b蛋白在叶绿体和线粒体中均有定位,LcAOX2蛋白定位于线粒体基质.采用RT-qPCR方法研究AOX基因在鹅掌楸茎、叶片、叶芽、花芽、花萼、花瓣、雄蕊、雌蕊8个不同组织中的表达模式,分析发现鹅掌楸AOX基因在花器官中表达量明显高于营养器官,LcAOX1a与LcA-OX1b基因在雄蕊中表达量最高,特别是LcAOX1a基因在雄蕊中特异性表达,其表达量远远高于其他组织;LcAOX2基因在花瓣中表达量最高.该研究克隆3个鹅掌楸AOX基因并进行相关分析,为进一步研究其生物学功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李火根	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	61	695	15.0	24.0
2	王曦	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	3	2	1.0	1.0
3	郝自远	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	6	6	1.0	2.0
4	宗亚仙	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	1	0	0.0	0.0
5	温少莹	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	1	0	0.0	0.0