鹅掌楸DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆及表达分析

• 作者: 徐嘉娟 李火根
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 鹅掌楸 棕榈酰化修饰 蛋白质酰基转移酶 DHHC蛋白家族 表达分析
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 植物生理与遗传育种
• 页码范围: 1052-1060
• 页数: 9页
• 分类号: Q943
• 字数: 6580字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201503026

摘要

棕榈酰化修饰是一种最普遍且唯一可逆的翻译后脂质修饰方式,赋予蛋白质多样化的生理功能。DHHC( Asp-His-His-Cys)蛋白家族是一类与棕榈酰化修饰相关的蛋白,多数DHHC蛋白家族成员具有蛋白质酰基转移酶( protein S-acyltransferase,PAT)活性。该研究以鹅掌楸叶芽为材料,采用RT-PCR和RACE技术,克隆获得了3个鹅掌楸DHHC蛋白家族基因cDNA全长,命名为LcPAT7、LcPAT22、LcPAT23。序列分析结果表明：LcPAT7、LcPAT22、LcPAT23基因全长分别为1933、2592、2217 bp,各包含1332、1839、1662 bp的开放阅读框( Open Reading Frame,ORF),编码433、612、533个氨基酸,预测蛋白分子量分别为40.04、67.3、60.57 kDa,理论等电点为9.15、9.03、7.29。3个基因编码的蛋白均有4个跨膜区,并且都在跨膜域( transmembrane domain, TM) TM2和 TM3之间存在一个 DHHC 蛋白家族典型的 DHHC-CRD 结构域。同源性分析表明：鹅掌楸LcPAT7、LcPAT22、LcPAT23编码的氨基酸序列与其他植物中预测的PAT具有较高的相似性。利用荧光定量PCR技术检测3个基因在鹅掌楸不同组织中的表达特性,发现3个基因在不同组织中均有表达,但表达量具有明显区别。同一家族基因表达模式的变化表明其功能非冗余。该研究结果将为鹅掌楸生长发育与形态建成,以及逆境响应信号传导等相关基因的调控研究提供了参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李火根	南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室	61	695	15.0	24.0
2	徐嘉娟	南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室	3	8	2.0	2.0