北美鹅掌楸CPP转录因子家族LtTCX2基因的克隆与分析

• 作者: 刘换换 张成阁 李火根 杨立春 郝自远
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 北美鹅掌楸 CPP-like家族 LtTCX2基因 CRC结构域 组织特异性表达
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传与育种
• 页码范围: 998-1009
• 页数: 12页
• 分类号: Q943
• 字数: 7152字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201908003

摘要

CPP(cystein-richpolycomb-likeproteinor Tesmin/TOS1-like)家族属于成员数目较少的一类转录因子基因家族,含有保守的富含Cystein的CRC结构域,在植物发育进程中,主要参与花发育、细胞分裂、分子进化等.为了探索CPP转录因子家族在北美鹅掌楸花发育中的作用,该文以北美鹅掌楸(Liriodendron tulipifera)为材料,采用RACE技术克隆出1个CPP-like家族基因,命名为LtTCX2,全长2866 bp.通过NCBI网站在线分析,ORF长2424 bp,编码了807个氨基酸,含2个保守的TSO1-like CXC结构域,分子量为88699.25 Da,理论等电点为5.83,不稳定系数为62.38,疏水性平均值为-0.619,预测为亲水性蛋白、非跨膜蛋白、核蛋白,不含信号肽及切割位点.氨基酸比对及系统进化分析结果显示,LtTCX2与其他物种的CPP家族TCX蛋白具有较高的同源性,与亚洲莲(Nelumbo nucifera)的NnTCX2、胡杨(Populus euphratica)的PeTCX2进化关系最近.荧光定量PCR结果显示,LtTCX2基因在叶片中表达量最高,在萼片、花瓣中几乎不表达,表达量由高至低如下:叶片、花芽、雌蕊、雄蕊、茎、根、花瓣、萼片.以上结果说明,LtTCX2属于较古老、保守的一类基因,可为从分子生物学层面研究鹅掌楸属植物系统进化提供一定的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李火根	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	61	695	15.0	24.0
2	郝自远	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	6	6	1.0	2.0
3	刘换换	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	3	1	1.0	1.0
4	杨立春	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	1	0	0.0	0.0
5	张成阁	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	1	0	0.0	0.0