虾夷扇贝选育群体与野生群体基因组DNA甲基化的MSAP分析

• 作者: 刘志鸿 吴彪 周丽青 孙秀俊 杨爱国 董迎辉 郑利兵 郑言鑫
• 来源期刊: 海洋与湖沼
• 学科: 生物学
• 关键词: 虾夷扇贝 “玉贝” DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性(MSAP)
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 页码范围: 976-982
• 分类号: Q75
• 语种: 中文
• DOI: 10.11693/hyhz20141000267

摘要

基因组DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要手段之一,在水产科学领域得到越来越广泛的应用.为从表观遗传学角度探讨虾夷扇贝选育群体-“玉贝”和普通虾夷扇贝群体的DNA甲基化差异,本文运用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)技术分析了两群体的DNA序列中CCGG位点的甲基化情况.结果表明,筛选得到11对引物组合能够在两个群体中得到稳定扩增、清晰且多态性丰富的片段;11对引物在“玉贝”和对照群体中分别共检测到1432和1442个位点,其中发生甲基化的位点分别为306和341个,总甲基化率分别为21.5％和23.65％,“玉贝”总甲基化率下降2.15％;全甲基化位点分别为152和236个,全甲基化率为10.68％和16.37％,“玉贝”全甲基化率下降5.69％;半甲基化位点分别为154和105个,半甲基化率为10.82％和7.28％,“玉贝”半甲基化率上升3.54％;“玉贝”群体的甲基化多态性条带所占比例高于对照群体,分别为31％和29.167％,尤其是B类型条带链,“玉贝”群体明显高于对照群体.这说明,通过对虾夷扇贝生长和耐热性状的累代选育导致了DNA甲基化水平和模式的改变,本研究为进行虾夷扇贝抗逆基因的筛查提供了参考数据,丰富了表观遗传学在扇贝中的研究资料.