不同镉积累基因型烟草CAX2基因克隆及序列分析

• 作者: 周慧娜 商慧文 张艳玲 翟妞 郭园园 陈江华
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 普通烟草 黄花烟草 CAX2基因 序列分析 镉转运
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子生物学
• 页码范围: 181-187
• 页数: 7页
• 分类号: S572
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/jissn.2095-1191.2015.2.181

摘要

【目的】克隆不同镉积累基因型烟草中阳离子转运基因（CAX2），为研究烟草CAX2基因在镉转运过程中的作用机理提供参考。【方法】根据NCBI中马铃薯的CAX2序列，BLAST烟草EST数据库，设计引物克隆普通烟草（Nicotiana tabacum）K326和黄花烟草（N. rustica）的CAX2基因，使用生物信息学方法进行序列分析。【结果】K326和黄花烟草CAX2基因（分别命名为NtCAX2和NrCAX2）编码区长度均为1314 bp，核苷酸序列一致性达98.0%；二者均编码437个氨基酸，仅有5个氨基酸位点存在差异。NtCAX2和NrCAX2蛋白同源性为98.9%，均有两个完全相同的Na+-Ca2+交换蛋白结构域，分别位于CAX2102~249 aa和293~426 aa区域，具有CAX家族共有的结构特征。NtCAX2和NrCAX2理论等电点分别为5.54和5.45，均有较强疏水性，包含11个跨膜结构域和两个重复区域α-1、α-2，三级结构以α-螺旋为主。系统进化分析结果表明，NtCAX2和NrCAX2与马铃薯（StCAX2）的亲缘关系最近，蛋白同源性均高于92.0%。【结论】K326和黄花烟草CAX2基因同源性较高，CAX2基因在茄科具有较高保守性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈江华		36	2365	23.0	36.0
2	张艳玲		5	167	4.0	5.0
3	郭园园		1	3	1.0	1.0
4	周慧娜		1	3	1.0	1.0
5	商慧文		1	3	1.0	1.0
6	翟妞		1	3	1.0	1.0