鸡堆型艾美尔球虫3-1E抗原表位的生物信息学预测

• 作者: 丛培君 任玉东 冯俪 李广兴 潘龙 马玲 黄小丹 黄艺华
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡堆型艾美尔球虫 3-1E蛋白 抗原表位 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 38-43,74
• 页数: 7页
• 分类号: S852.31
• 字数: 4080字
• 语种: 中文

摘要

应用生物信息学分析和预测鸡堆型艾美尔球虫3-1E蛋白二级结构和抗原表位,为确定和筛选优势表位,研制安全、高效表位疫苗奠定基础.以克隆获得的鸡堆型艾美尔球虫3-1E蛋白氨基酸一级结构为基础,采用DNAStar软件和生物信息学在线分析程序ProtParam、SOSUI、IEDB、SYFPEITHI等预测3-1E蛋白理化性质和二级结构,并分析其序列跨膜区、可溶性、亲水性、可及性、柔韧性参数以及抗原指数,预测B细胞表位和T细胞表位的可能区域.3-1E蛋白由170个氨基酸组成,分子式C818H1257N213O272S3,分子质量18.5234 ku,理论等电点为4.25,半衰期为10h;无跨膜区均为膜外区,是一种可溶性蛋白.其二级结构中α螺旋占31.76％,β转角为12.35％.B细胞表位预测区域:44-49、65-67、86-87、111-116;分值较高的T细胞表位区域:52-60、94-102、97-105、154-162、157-165.运用生物信息学方法确定3-1E存在多个抗原表位,对进一步研究3-1E的抗原性和研发优势表位疫苗具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李广兴	东北农业大学动物医学学院	93	553	14.0	20.0
2	潘龙	东北农业大学动物医学学院	12	45	5.0	6.0
3	任玉东	东北农业大学电气与信息学院	20	83	4.0	9.0
4	黄小丹	东北农业大学动物医学学院	9	18	3.0	3.0
5	马玲	东北农业大学动物医学学院	2	5	1.0	2.0
6	冯俪	东北农业大学动物医学学院	3	7	2.0	2.0
7	黄艺华	东北农业大学动物医学学院	3	7	2.0	2.0
8	丛培君	东北农业大学动物医学学院	1	5	1.0	1.0