西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白基因克隆及序列分析

• 作者: 何丹 李继阳 杨渡 海利力·库尔班 玉山江·麦麦提 韩盛
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 甜瓜 西瓜花叶病毒 外壳蛋白 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 页码范围: 1849-1858
• 页数: 10页
• 分类号: S436.5|S188
• 字数: 6732字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2015.010.013

摘要

[目的]研究新疆甜瓜主栽区西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白的分类地位,以及与国内外分离株亲缘关系.[方法]田间采集具有西瓜花叶病毒症状的幼嫩叶片,利用改良的TRIZOL总RNA提取法获取RNA,进一步分离纯化、克隆及测序,将测序结果利用BLAST、DNAMAN 5.0、CLUSTAL X、MEGA 5.0 EXPASY、TM-HMM等软件进行碱基和氨基酸序列比对,以及疏水性平均值、脂肪系数、亲缘关系等分析.[结果]序列比对发现8个地区WMV病毒外壳蛋白核酸序列的5'端保守性较高,碱基和氨基酸序列相似性分别达到86.25％和93.01％,存在部分碱基和氨基酸突变,相似性较高.[结论]通过分子进化树可得出新疆8个分离物之间亲缘性关系较近,同源性较高,与国内外其它地区的亲缘性关系较远、同源性较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨渡	新疆农业科学院植物保护研究所	9	47	4.0	6.0
2	韩盛	新疆农业科学院植物保护研究所	11	49	4.0	6.0
3	玉山江·麦麦提	新疆农业科学院植物保护研究所	8	29	4.0	5.0
4	海利力·库尔班	新疆农业大学林学与园艺学院	17	240	8.0	15.0
5	何丹	新疆农业大学林学与园艺学院	4	21	3.0	4.0
6	李继阳	新疆农业大学林学与园艺学院	1	4	1.0	1.0