黄瓜花叶病毒贵州辣椒分离物外壳蛋白基因序列分析

• 作者: 付尚松 杨学辉 王莉爽 蒋选利
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 黄瓜花叶病毒 辣椒 CP基因 贵州
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农业气象
• 页码范围: 108-114
• 页数: 7页
• 分类号: S436.421.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.01.014

摘要

[目的]分析贵州辣椒主产区黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)分离物的分子变异情况,为抗病毒辣椒品种选育及辣椒病毒病的防控提供科学依据.[方法]以来自贵州省8个县(榕江、大方、石阡、安龙、绥阳、德江、关岭和惠水)的16个辣椒CMV分离物为材料,采用逆转录—聚合酶链反应(RT-PCR)扩增辣椒CMV分离物的CP基因序列,利用DNAMAN和BioEdit对CMV分离物的CP基因序列进行比对分析,用MAGE 7.0的邻接法(Neighbor-joining,NJ)构建系统发育进化树,分析贵州辣椒CMV分离物的遗传多样性.[结果]将16个贵州辣椒CMV分离物的CP基因核苷酸序列及编码蛋白氨基酸序列与CMV亚组代表株系进行一致性比对,结果表明,贵州辣椒CMV分离物与CMV亚组分离物的CP基因核苷酸序列一致性为89.7％～100.0％、CP蛋白氨基酸序列一致性为96.8％～100.0％.系统进化分析结果表明,CMV-DF、CMV-RJ、CMV-SQ、CMV-SY、CMV-DJ与CMV I代表株系聚为一个亚支,但更趋近于CMV亚组IB株系,CMV-HS、CMV-GL、CMV-AL与CMV亚组Ⅱ株系聚为另一个亚支,说明侵染贵州辣椒的CMV株系有两大组群,其中大方、榕江、绥阳、石阡和德江CMV分离物归属于CMV亚组IB株系,惠水、关岭和安龙CMV分离物归属于CMV亚组Ⅱ株系.[结论]不同地域的贵州辣椒CMV株系发生了变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨学辉	贵州省农业科学院植物保护研究所	29	280	10.0	15.0
2	蒋选利	贵州大学农学院	45	282	10.0	13.0
3	王莉爽	贵州省农业科学院植物保护研究所	6	1	1.0	1.0
4	付尚松	贵州大学农学院	1	0	0.0	0.0