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侵染安徽玉米的水稻黑条矮缩病毒全基因组特征
侵染安徽玉米的水稻黑条矮缩病毒全基因组特征
作者:
何志龙
张享享
李祥宇
江彤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
水稻黑条矮缩病毒
安徽分离物
全基因组
序列分析
摘要:
[目的]测定水稻黑条矮缩病毒(Rice black-streaked dwarfvirus,RBSDV)安徽分离物全基因组序列,分析RBSDV安徽分离物与RBSDV其他分离物以及斐济病毒属(Fijivirus)其他成员之间的分子差异,为明确RBSDV遗传变异与进化规律提供重要信息.[方法]采用RT-PCR法从安徽玉米粗缩病样本中扩增RBSDV的全基因组,克隆、测序并进行序列分析.[结果]获得RBSDV安徽分离物全基因组序列.序列比对发现,RBSDV安徽分离物与其他RBSDV各个分离物S1到S10的序列相似性较高,为87.6% ~ 99.5%,其中与RBSDV韩国分离物(RBSDV-KOR)序列相似性最高,达94.6% ~ 99.5%;从构建的系统关系树也可以看出,RBSDV安徽分离物和其他所有RBSDV分离物均聚成一个单独的分支.[结论]RBSDV各分离物之间亲缘关系很近.RBSDV安徽分离物与RBSDV-KOR亲缘关系最近,可能起源于相同的祖先.另外,推测RBSDV各个基因组片段可能是协同进化的.
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文献信息
篇名
侵染安徽玉米的水稻黑条矮缩病毒全基因组特征
来源期刊
南京农业大学学报
学科
农学
关键词
水稻黑条矮缩病毒
安徽分离物
全基因组
序列分析
年,卷(期)
2015,(6)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
943-949
页数
分类号
S435.111.4
字数
语种
中文
DOI
10.7685/j.issn.1000-2030.2015.06.011
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
江彤
安徽农业大学植物保护学院
62
201
6.0
10.0
2
张享享
安徽农业大学植物保护学院
7
6
1.0
2.0
3
李祥宇
安徽农业大学植物保护学院
5
19
3.0
4.0
4
何志龙
安徽农业大学植物保护学院
2
4
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2.0
传播情况
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安徽分离物
全基因组
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
南京农业大学学报
主办单位:
南京农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2030
CN:
32-1148/S
开本:
大16开
出版地:
南京市卫岗1号
邮发代号:
28-53
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
2940
总下载数(次)
5
总被引数(次)
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